Опубликованная редакция пока не является утверждённой стратегией. В течение последних полутора лет проект неоднократно обсуждался и перерабатывался, а отдельные его положения вызвали возражения руководителей заповедников, учёных и природоохранных организаций. Наиболее острая дискуссия развернулась вокруг централизации управления федеральными ООПТ и возможного изменения их границ.
По данным проекта, на 30 июня 2026 года в России насчитывалось около 12 тыс. ООПТ федерального, регионального и местного значения общей площадью более 245 млн га — около 14% территории страны. В систему федеральных ООПТ входят 112 государственных природных заповедников, 75 национальных парков, 66 заказников, 37 памятников природы, а также 51 дендрологический парк и ботанический сад.
Федеральные ООПТ занимают более 76 млн га, включая 20,5 млн га морских акваторий. При этом основная часть охраняемых территорий относится к региональному уровню: на них приходится 89% общего количества и половина совокупной площади российских ООПТ.
Главное организационное предложение проекта — реорганизация федеральных учреждений, управляющих заповедниками, национальными парками и заказниками, путём их присоединения к ФГБУ «Информационно-аналитический центр поддержки заповедного дела», известному как Росзаповедцентр.
В ведении Минприроды находятся 283 ООПТ, которыми управляют 139 федеральных учреждений. Сейчас эти организации имеют собственное руководство, инспекторский состав, государственные задания и финансовые полномочия. После присоединения к Росзаповедцентру они могут перейти в статус территориальных подразделений единой структуры. Предложенная модель вызвала возражения части профессионального сообщества. Руководители ООПТ указывают, что централизация может увеличить количество согласований и затруднить принятие оперативных решений непосредственно на охраняемых территориях.
Количество посетителей федеральных ООПТ планируется увеличить с 22,6 млн человек в 2025 году до 35 млн в 2030-м. К этому же сроку все 73 национальных парка, находившиеся в ведении Минприроды на середину 2026 года, должны получить минимальный набор туристической инфраструктуры. Одновременно проект признаёт, что увеличение потока посетителей создаёт дополнительную антропогенную нагрузку. Для её регулирования предлагается рассчитывать допустимую посещаемость, учитывать рекреационную ёмкость маршрутов, проводить паспортизацию экологических троп, организовать раздельное накопление и вывоз отходов, а также распределять туристический поток между наиболее востребованными и менее посещаемыми территориями.
Ещё один чувствительный вопрос касается границ охраняемых территорий. Проект стратегии предусматривает совершенствование законодательства в части «регулирования возможности изменения границ ООПТ федерального, регионального и местного значения». Подробный порядок и основания таких изменений непосредственно в стратегии не установлены.
Обсуждение документа продолжается. Ключевыми нерешёнными вопросами остаются модель реорганизации 139 учреждений, порядок изменения границ охраняемых территорий, распоряжение внебюджетными доходами и соотношение роста туристического потока с требованиями сохранения природных комплексов.

